1880-1897 Documents fondateurs (inclut les dispositions testamentaires de la sénatrice Jenisch (1880), le règlement d'administration (1896) et la plaquette d'inauguration en 1897)
1883-2022 Correspondance avec la société des Beaux-Arts (1886-1915), inauguration, don de la collection ethnographique au Musée cantonal d'archéologie et d'histoire (1925), exploitation, expositions et dons, collections du cabinet des estampes, catalogues des œuvres (1962-1968), coupures de presse réunies par Bernard Blatter (1983), don de la collection des science de la terre au Musée cantonal de géologie en 2009 (inclut également la correspondance)
1887-1998 Commission des Beaux-Arts : rapports annuels du conservateur, correspondance, rapports annuels, comptes
1896-1959 Procès-verbaux de la commission des Beaux-Arts
1925-1931 Cahier des dépenses
1960-1981 Dossier Courbet
1985-2012 Fondation des amis du Musée des Beaux-Arts
2007-2012 Fondation Oskar Kokoschka